20世紀少年 －第1章－ 終わりの始まり

Estate 1969: Kenji e i suoi amici costruiscono un nascondiglio segreto in un terreno abbandonato. Iniziano quindi a stilare il "Libro delle Profezie", in cui i bambini s'inventano una storia in cui devono combattere contro dei malvagi che vogliono conquistare il mondo.
1997: Kenji è padrone di un piccolo minimarket a conduzione familiare; abbandonato il suo sogno giovanile di diventare una rockstar, sembra aver accettato l'idea di vivere un'esistenza normale, impegnandosi nel frattempo ad accudire la nipote Kanna, figlia della sorella Kiriko morta prematuramente. La sua quotidianità viene scombussolata quando uno dei suoi vecchi compagni di scuola, Donkey, muore misteriosamente; subito dopo una famiglia vicina di casa di Kenji scompare.
Mentre una catena di eventi sembra ripercorrere gli eventi descritti nel Libro delle Profezie, fa la sua comparsa una setta religiosa guidata da un misterioso leader, che si fa chiamare l'Amico.
Sta per iniziare la fine del mondo? E chi è l'Amico?