Säsongen 5 av Alias startade på ABC (US) på Thursday 29 September 2005, Detta är den pågående säsongen, den har bara ett avsnitt för tillfället..
Sydney Bristow, an agent who has been tricked to believe she is working for the U.S. government is actually working for a criminal organization named the Alliance of Twelve. Upon learning this, Sydney becomes a double agent for the real CIA.