Rupert Thorne bleibt verschwunden, und sein Nachfolger Eddie Nygma alias der Riddler versetzt Gotham in Angst und Schrecken. Brutale Straßengewalt und dreiste Raubzüge nehmen überhand, und das GCPD ist hoffnungslos überfordert. Um mehr über Thornes Aufenthaltsort und Hintergründe zum neuen Capo Nygma zu erfahren, infiltriert Batman als Matches Malone das Blackgate-Gefängnis.