Arcanes plonge au cœur de Gravines, une petite ville industrielle des années 90, marquée par la fermeture de l’usine MTLK, pilier économique et social depuis des générations. Lorsque Stella, une adolescente, disparaît, Clémence Rosier, héritière et ancienne directrice de l’usine, voit resurgir le drame de la mort non élucidée de son fils Benjamin, survenue deux ans plus tôt.