Per sorpresa di Lelouch, C.C., la ragazza che gli ha dato il potere, è viva e adesso vive nella sua residenza. Suzaku, essendo stato assolto da tutte le accuse incontra casualmente la Terza Principessa Euphemia Li Britannia e la situazione finisce dovendo intervenire in una lotta interna nella fazione dei Puristi. Nel frattempo, la Seconda Principessa Cornelia Li Britannia si sforza di prendere in carico il ruolo di Governatore dell'Area 11 e portare Zero,il nemico numero uno dell'Impero e l'uomo più ricercato, alla giustizia.