Mentre Walter e Peter fanno progressi con la macchina e Olivia fa degli strani sogni e i suoi ricordi sembrano mostrarle la realtà dell'Olivia di Peter, nei pressi della cittadina di Westfield qualcosa di strano accade alle auto: improvvisamente smettono di funzionare e un aereo, avendo perso i controlli, precipita uccidendo tutti i viaggiatori. Viste le anomalie, la Fringe Division si reca sul posto e, dopo i primi accertamenti, Olivia, Peter e Walter, lasciato finalmente il suo laboratorio, si recano a Westfield dove Walter ha sentito facciano un'ottima torta al rabarbaro. Una volta lì, però, i tre notano subito qualcosa che non va: Olivia non riesce a telefonare, Peter trova un uomo ferito gravemente in un ripostiglio mentre Walter viene aggredito dal cameriere. Dopo l'intervento di Olivia, i tre cercano di portare Cliff, l'uomo ferito, in ospedale ma qualcosa glielo impedisce: non riescono a lasciare la città, continuando a girare intorno. Giunti nella stazione di polizia per aiutare Cliff, dall'uomo i tre scoprono che qualcosa, come una schizofrenia generale, ha colpito quasi tutti gli abitanti, tranne alcuni riuniti nel liceo, che sono immuni perché i loro doppi, grazie a scelte diverse si trovano altrove. Così, per andare in loro soccorso, Olivia, Peter, Walter e Cliff si recano al liceo e, durante il tragitto, Olivia confessa a Peter di provare gli stessi sintomi delle persone descritte da Cliff. Arrivati al liceo, dopo alcune analisi, Walter rassicura Olivia di non essere malata e, inoltre, confessa a lei e a Peter di aver capito cosa stia succedendo: la città di Westifield si sta unendo con la sua rispettiva dell'altro universo. Dopo un iniziale sconforto, Walter grazie a Peter riesce a trovare una soluzione: spostare i superstiti nel centro del ciclone, unico posto che non verrà inghiottito dall'unione tra le città. Arrivati per un pelo nel posto, Walter, Peter e Olivia riescono a salvarsi e a salvare i superstiti, messi poi in salvo dall'arrivo