Walter riesce a recuperare e visionare un'altra cassetta intrappolata nell'ambra, il video porta a una palazzina e a un particolare appartamento, vi sono inoltre delle istruzioni che (a detta di Walter della cassetta) andranno seguite alla lettera. Giunto sul posto Walter trova un palazzo cadente, bombardato durante i tentativi di resistenza vent'anni prima. Una volta nell'appartamento, lo si vede effettuare degli strani passi e sparire all'improvviso. Olivia e Peter intanto tornano a casa e trovano la videocamera, visionando il video capiscono che Walter è andato da solo a cercare il pezzo successivo del piano per annientare gli Osservatori, scoprono che Walter e Donald hanno creato una sacca extra dimensionale in cui nascondere il pezzo, il video però si interrompe al passaggio di Walter nel portale. Arrivati anche loro nell'appartamento, Peter e Olivia entrano nella sacca dimensionale e scoprono che è un posto strano, dove le leggi della fisica, il tempo e lo spazio si comportano in modo strano, a quel punto la videocamera riprende a funzionare, mostrando la parte di filmato girata in quella strana dimensione. Walter intanto incontra Cecil, un ladro di appartamenti finito per sbaglio nella sacca, curiosamente Cecil afferma di esser li da soli 5 giorni, ma è stato spinto dall'esplosione del bombardamento avvenuto 20 anni prima. Reincontratosi con Peter e Olivia, Walter visiona la parte nascosta del video e scoprono che il pezzo mancante era un ragazzino calvo, che Peter e Olivia hanno già conosciuto in un caso Fringe (episodio 1x15 - Empatia). Il ragazzo è stato nascosto dietro una porta con uno strano Glifo, mezza mela (ogni porta reca uno dei Glifi della serie), ma nella stanza non c'è nessuno, solo una radiolina apparentemente fuori uso. Nel frattempo due Osservatori raggiungono la sacca, il gruppo riesce a uscirne appena in tempo grazie a Peter che riesce a vedere il passaggio (cosa possibile grazie al congegno che si è auto innestato) e Olivia riesce