Bullock e Gordon scoprono che il signor Penn lavora anche per Sofia e capiscono che è la persona chiave nel controllo della spietata ragazza su Gotham. Lee Thompkins si allea con Pinguino per uccidere l'ultima della dinastia dei Falcone e lo fa congelare da Fries usandolo come Cavallo di Troia contro Sofia. Ne scaturisce una guerra e un faccia a faccia tra Gordon e Sofia, la quale, mentre sta facendo partire l'ultimo colpo di pistola verso il suo amato e odiato detective, viene fermata da Lee che la manda in coma sparandole in testa.