Boss, accompagnato da Shiro, Nuke e Mucha cadono in una trappola della Marchesa Yanus che li attira sulla sua isola e li fa prigionieri, offrendoli a Kabuto in cambio di Mazinga. Tetsuya si reca sull'isola ma subisce gli attacchi del mostro, a causa della presenza degli ostaggi. Ma i ragazzi si liberano fuggendo dalle caverne dei Catloo lasciando via libera al Grande Mazinga che però viene attirato sul fondo di una fossa marina.
Nel frattempo l'Isola Vulcanica della Marchesa Yanus attacca la Fortezza delle scienze che cerca di difendersi alla bell'è meglio. Nell'abisso il combattimento è per la vita o per la morte ma alla fine è Mazinga che la spunta e risale in superficie dove viene aiutato da Venus a uscire dai meandri della fossa oceanica tornando in tempo per difendere la base e scacciare il nemico.