Harm e Mac si occupano del caso di Joan Steele, un Sergente dei Marines ritrovata a bordo di un vascello di terroristi che ha attaccato una nave americana: i due devono scoprire se la donna è stata rapita o se è una complice dei criminali. Steele, rapita dai terroristi un mese prima dell'aggressione al vascello della marina, insiste che le indicazioni che ha fornito erano volte a determinare il fallimento del piano, ma Harm non è convinto della sua innocenza. Webb chiede la collaborazione della donna per identificare un altro terrorista che sta organizzando un piano per distrugger un'altro obiettivo nelle prossime 48 ore.