Harm, Mac e Turner si scontrano contro la CIA a causa di una tragedia del 1968 in cui morirono 129 marinai, ma l'Agenzia insiste a considerare il caso top secret e si rifiuta di rilasciare la documentazione. Il team del JAG deve trovare un modo per aggirare l'ostacolo e portare a termine l'incarico ricevuto dal Segretario della Marina.