Nikita continua a mostrare evidenti segni della riprogrammazione soprattutto durante una missione in cui rischiano di morire tanti bimbi innocenti. Michael è determinato a “curare” Nikita e prende contatti con Ross Gelman, l'inventore di questo progetto che è stato usato sulla ragazza. Operations è abbastanza orgoglioso di questa nuova Nikita, Madeleine invece si dichiara preoccupata, conosce la capacità di fingere di Nikita e soprattutto la caparbietà di Michael. Operations decide quindi di usare misure estreme...