Quando l'NCIS indaga sulla misteriosa morte di un ingegnere della Marina, Joseph Chan, scoprono che l'ultima persona che ha incontrato è stata la sua collega, Maggie Shaw, mentore e amica di Jane, che è stata rapita. Inoltre, David Sola, un funzionario del servizio di intelligence della Nuova Zelanda, arriva alle Hawaii, a seguito di una pista che collega la morte di Joseph a un agente segreto cinese nero.