Uno psicologo consiglia a Tess di portare il piccolo Alexander in una struttura, al fine di poterlo meglio osservare data la sua insolita personalità, e la donna sembra accettare. Lois decide di dire a Clark che sa il suo segreto, e allo stesso tempo anche Clark vuole rivelare a Lois di essere La Macchia. Ma la dea Iside, che vuole riportare in vita il marito Osiride, si impossessa di Lois facendo saltare i piani. Cat Grant torna a Metropolis e, dopo averla vista usare i suoi superpoteri, si convince che Lois/Iside sia La Macchia. Clark e Oliver sono costretti a chiedere aiuto a Tess, che si dimostra essere all'altezza della scomparsa Chloe, e riescono così a liberare il corpo di Lois dall'anima di Iside. Tess e Oliver si scusano a vicenda per le controversie avute nel passato e cominciano entrambi ad accettare i cambiamenti che si stanno verificando nelle loro vite (per Oliver la fine della sua storia con Chloe, e per Tess il suo rapporto con Alexander). Finalmente Clark e Oliver decidono di fidarsi di Tess e, con sua grande sorpresa, le affidano il compito che aveva Chloe alla Watchtower. Tess, ora completamente diversa, capisce che Alexander ha bisogno più di ogni altra cosa di essere amato e decide di tenere con sé il bambino, che però comincia a manifestare i primi problemi derivati dalla clonazione: cresce troppo in fretta. Infine, Clark rivela a Lois il suo segreto, ma scopre che la donna lo sapeva già.