Sisko entra in contatto con le entità non lineari che vivono nel tunnel spaziale e, nel tentativo di spiegare loro l'esistenza umana attraverso i propri ricordi, è costretto a rivivere il trauma della morte della moglie a Wolf 359. Intanto Kira deve affrontare l'arrivo della flotta cardassiana di Gul Dukat, intenzionata a riprendere il controllo del tunnel.