Un'anomalia su una collina non lontana dalla base mette tutti in allerta e Miwa parte in ricognizione. Hiroshi nel frattempo è ospite presso un innovativo hotel volante. Durante i festeggiamenti presto il giovane scopre che in realtà tutti gli invitati sono guerrieri Aniba e Flora è a capo di tutto. Drogato e immobilizzato, Hiroshi rimane solo al cospetto di Flora. Hiroshi, basandosi la sensibilità di Flora, cerca di convincerla a redimersi, ricordandole che è l'Imperatore il responsabile della morte dei suoi genitori. Ma quando la sua fedeltà sembra crollare interviene l'Imperatore che la condanna come traditrice. Miwa nel frattempo ha individuato nel ristorante la sorgente delle anomalie magnetiche e infatti, preso il volo, si rivela essere la base imperiale di Himika. Flora intanto, sorvegliata ma Ikima e Amaso, sobilla anche i due ministri che, convinti delle parole della ragazza, la liberano per consentirle di compiere le sue scelte. Di corsa di getta nella sala del prigioniero dopo aver eliminato un paio di soldati. Il momento è dei più coinvolgenti: Flora finalmente si è convertita al bene e apre il suo cuore a Hiroshi che non intende lasciarla sulla base. Flora però intende restare per affrontare la sua nemesi: l'Imperatore responsabile del suo infelice destino. Nel frattempo, la Base Antiatomica attaccata dalla Nave dell'Imperatore, solleva la sua capsula mentre sbuca l'ennesimo mostro Aniba affrontato da Jeeg. La nave ristorante viene seriamente danneggiata e distrutta definitivamente in una grande esplosione. Flora, avvinghiata dalle fiamme, viene sbalzata fuori dal relitto. Jeeg, in preda al dolore, elimina rabbiosamente il nemico di turno e si getta a capofitto a soccorrere Flora ma ormai è troppo tardi. La giovane muore fra le mani di Jeeg, felice per aver potuto conoscere l'amore grazie alle parole di Hiroshi che le hanno dato la forza di ribellarsi al male. Il corpo scompare e come d'incanto tutti prati circostanti rifioriscono in un arcob