La stagione 3 di Pinky and the Brain è stata trasmessa su The WB da lundi 8 septembre 1997 a samedi 16 mai 1998. È composta da 51 episodi, il primo dei quali si chiama "Leave It to Beavers" e l'ultimo "Brain Food"..
Mignolo e il Prof sono due topolini da laboratorio molto particolari. Il Prof è tanto intelligente quanto intenzionato a conquistare il mondo, mentre Mignolo è il suo aiutante tanto tonto quanto di buon cuore.