Anno 0079 UC, inizio della Guerra di un anno. L'ufficiale ingegnere Oliver May è un membro effettivo della 603ma Unità di Valutazione Tecnica dell'Esercito del Principato di Zeon, incaricata di provare sul campo le nuove tecnologie militari. A bordo del cargo Jotunheim il tenente May e gli altri membri dell'Unità prendono parte a diversi episodi chiave nel corso della prima parte della guerra, nota anche come Guerra di una settimana, tra cui l'Operazione British e la fondamentale battaglia di Loum, che vide la flotta federale pesantemente sconfitta da una nuova arma in dotazione alle forze di Zeon, il mobile suit.
Nella seconda fase della guerra, continua il duro lavoro di test della 603ma Unità, nel tentativo disperato di trovare nuove soluzioni belliche che possano dare in extremis la vittoria a Zeon.
Nella terza serie con nuovi personaggi l'attenzione si sposta sul fronte terrestre e l'azione è narrata dal punto di vista dei soldati della Federazione.