Quando a Departamento de Segurança Interna inexplicavelmente sela uma cena de crime envolvendo um carro-bomba, Castle e Beckett se veem diante de dois mistérios: quem matou a vítima, um informante do governo? E por qual razão os agentes federais assumiram o caso? A situação se complica quando eles descobrem que a vítima não foi morta pela explosão, mas sim por um drone.