A equipa Fringe, preservada em âmbar durante 20 anos, é agora uma resistência rebelde que luta pela liberdade. Peter, reunido com a sua filha já adulta, Etta, tenta descobrir o que aconteceu à sua esposa e mãe de Etta, Olivia, enquanto eles também iniciam a sua missão para salvar o mundo dos Observadores.