В тот день, когда она была еще ребенком, ее отец, Кен, ушел на войну, оставив маленькую Анемону, и больше не вернулся. Глубокое сожаление о том, что она не смогла попрощаться, осталось в ее сердце. Прошло семь лет. Анемона оказалась на поле боя, где пал ее отец — в Токио. В качестве члена организации «Ассид», предназначенной для борьбы с врагом человечества, седьмым Эврика — Эврика Севен, на Анемону возложена надежда человечества. Она отправляет свой дух в Эврика Севен. В этом мире Анемона встречает юношу по имени Доминик и девушку с зелено-голубыми волосами по имени Эврика. Что означает эта встреча? И что за загадочный мальчик по имени Рентон, который появляется и исчезает? Загадочный мужчина по имени Дьюи, заключенный в «Ассид», предсказывает: «То, что вы видите как Эврика Севен, на самом деле не Эврика Севен. Это бесчисленные ненужные миры, созданные и уничтоженные ложным богом. Можно сказать, это гора мусора». Когда Анемона и…