Успешно сдав вступительные экзамены в Космическую Железнодорожную Полицию (SDF), Гаку уговаривает свою мать Канну отпустить его и прощается с родным городом Табито. Сев на поезд номер 550, направляющийся на "Планету Судьбы", главный вокзал SDF и стартовую станцию всей Галактической Железной Дороги, он случайно встречает Луи, который также собирается вступить в SDF. Внезапно поезд, в котором находятся Гаку и Луи, теряет управление и оказывается втянутым в искажение времени в космосе, известное как "Узел времени". Переместившись во времени, они оказываются на пустынной планете Хакмей пять лет назад. Там Гаку встречает своего брата Мору, который сражается с космическими пиратами пять лет назад...