Май 1969 года, Япония. В то время как для этой небольшой страны начинается новая эпоха процветания, мир сталкивается с ростом неестественных катастроф. Тайная организация, известная как A.E.G.I.S. (Система Глобального Перехвата Инопланетян), проследила свои корни до сущностей, известных как «Захватчики». В попытке предотвратить дальнейшие разрушения, Дальневосточное отделение ищет людей, обладающих силой открывать «ворота», также известных как «Хранители Ворот».
Тем временем мы знакомимся с подростком по имени Укия Шун, который живет с матерью и младшей сестрой Саэми. Мир Укии кардинально меняется, когда его дом оказывается под угрозой в битве между группой Захватчиков и первой рекруткой Дальневосточного отделения, Рурико Икусавой. Гнев Укии из-за опасности для его дома заставляет его неосознанно открыть ворота, которые он использует, чтобы в одиночку победить угрозу Захватчиков.