Спустившись в деревню ниндзя, Гинтоки и его друзья узнают, что Дзэндзо тайно передал тело сегуна Симосимы Ига. Однако в Ига появляется флот Харуамэ. Таксуги и его подручные замышляют сделать ниндзя мятежниками, которые хотят убить сегуна. На корабле Харуамэ вновь появляется Дзэндзо. Всё это ради защиты друга Симосимы. Один против флота Харуамэ, он вступает в отчаянную битву.