Поездка на пляж, которую Аки пообещала детям в 18-й серии, снова откладывается из-за проблем с машиной. Однако жизнь с инопланетянами имеет свои преимущества: Нацуму узнает о высокотехнологичной подводной лодке отряда Кероро и умоляет их отвезти её на пляж, слегка подрывая новый план Кероро по завоеванию мира через океаны. Фуюки тоже присоединяется, надеясь собрать океанографические данные для школьного проекта, но в итоге встречает таинственную девушку.
Истинное происхождение девушки намекается, когда подводные действия отряда Кероро по установке флага сталкиваются с серьезным сопротивлением — древняя цивилизация Нонтолма, уже разгневанная загрязнением океанов человечеством, намерена дать урок отряду Кероро.