Муто Юги, завершивший Тысячелетнюю Головоломку, начинает новую главу в своей жизни. На королевство спускается Кайба Сэитэн. Получив колоду, которую Юги вернул у мастера подражаний, Кайба сталкивается с вызовом от Дзёноути, и начинается дуэль.