La mort de Jun, le petit frère de Yahiro, a traumatisé Shuu. Il refuse de se battre à nouveau aux côtés de Gai et d'Inori et ne veut plus entendre parler du Void. C'est la déception chez les Croque-morts qui ne peuvent pas abandonner leur combat contre le GHQ pour autant. Shuu essaie de retrouver une vie ordinaire au lycée mais c'est sans compter avec les Anticorps et leurs plans pour le Japon...