Haru et ses amis partent à la poursuite de Rei, un hacker qui leur a dérobé les Appmon Seven Codes. Pour le retrouver, ils doivent plonger en plein cœur d'Internet, un ensemble de données cybernétiques. Haru, Gatchmon et leurs amis sont confrontés à Sakusimon, un Appmon à la fois très puissant et très dangereux qui veut mettre la main sur leurs Appli Drive. Ils sont alors secourus par Rei.