El cataclismo comienza. Enormes manadas de Raaja invaden Japón, sumiendo a la población humana en el caos. Sin embargo, impulsada por la voluntad de sobrevivir, la humanidad persevera en el vórtice de la tormenta cervecera. Tokio se niega a creer que se ha perdido la esperanza y decide salvar a Sayuri y a los demás. Mientras tanto, SEED prácticamente mantiene cautivo a Juna en su sucursal estadounidense. Juna se angustia por su incapacidad para rescatar a Tokio, su madre o su hermana. ¿Puede liberarse y salvar a quienes ama?