El viaje a la playa que Aki prometió a los niños en el episodio 18 se pospone nuevamente debido a problemas con el automóvil, pero vivir con extraterrestres demuestra tener sus ventajas, ya que Natsumi se entera del submarino de alta tecnología de Keroro Platoon y les ruega que lo tomen. ella a la playa, haciendo una pequeña mella en el plan más nuevo de Keroro, para conquistar el mundo a través de sus océanos. Fuyuki llega, con la esperanza de reunir algo de investigación oceánica para completar un proyecto escolar, pero termina conociendo a una chica misteriosa. Los verdaderos orígenes de la niña se insinúan cuando las actividades de plantación de banderas submarinas de Keroro Platoon se encuentran con una oposición sustancial: la antigua civilización Nontolma, ya enojada por la contaminación de los océanos por la humanidad, y que busca dar un ejemplo al Keroro Platoon.