Harlock y Mime han desaparecido de la faz de la Tierra y se les da por muertos. Kei Yuki, la segunda de Harlock sigue los pasos de éste y se ha convertido en la última pirata espacial que existe, la única que vive bajo los valores de libertad y justicia que siempre defendió su capitán. Ahora es perseguida por la policía espacial por ser una peligrosa delincuente. Ahora la humanidad se enfrenta a un peligro mayor que la anterior invasión y la Tierra (un planeta lleno de viejos y enfermos) corre el peligro de ser destruida. Pero la reaparición de Harlock y la nave Arcadia dará esperanzas a aquellos que aún creían en él y sabían que seguía vivo. Acaba de renacer la leyenda.