Tras haber pasado un tiempo como prisionero en una penitenciaría federal, un joven agente del FBI, afroamericano y musulmán, Darwyn (Michael Ealy, La barbería), comienza a entablar diversos contactos que le permiten infiltrarse en una celúla de terorrismo islámico que opera oculta en plena ciudad de Los Angeles. Este grupo está liderado por el intimidante y carismático extremista Farik (Oded Fehr, La momia), quien considera que todos los actos de violencia sirven al bien supremo de su causa. Pero pronto, algo en esta investigación sale mal, poniendo las vidas de los agentes, y la integridad de una misión de tres años, en serio peligro. En un país todavía atenazado por los ataques del 11 de septiembre de 2001 y por la creciente preocupación y miedo a actos de terrorismo, que lleva a la precaución de las autoridades, nos llega, Sleeper Cell, una serie que según sus creadores, Ethan Reiff y Cyrus Voris, responde a un esfuerzo, en sus propias palabras, para "conocer a tu enemigo."