Dopo due sanguinose guerre e quarant'anni di silenzio, i Cylon danno inizio alla loro pianificata vendetta, iniziata 2 anni prima con l'infiltrazione nelle Colonie di 12 modelli cylon dalle sembianze umane.Sul Galactica, l'ultima battlestar delle 12 originarie rappresentante Caprica, c'è aria di pensionamento sia per la gloriosa nave prossima a diventare un museo, sia per il suo Comandante William Adama.Pe l'occasione viene invitato a partecipare alla parata di decommissionamento Lee "Apollo" Adama, il figlio del Comandante. Tra i due i rapporti sono praticamanente assenti perché Lee ritiene il padre responsabile della morte del fratello Zak, deceduto due anni prima durante un'esercitazione di volo. Anche la stampa e il governo, con Laura Roslin, Segretario all'Educazione come rappresentante, viene invitato allo speciale evento.Kara "Starbuck" Thrace, fidanzata del defunto Zak e miglior pilota del Galactica, trova un modo originale per non partecipare alla parata: si fa spedire in cella dopo una scazzottata con il Colonnello Saul Tigh.I cylon però decidono di rovinare la festa distruggendo le 12 colonie con un improvviso attacco nucleare e mettendo in ginocchio in un batter d'occhio tutte le difese coloniali. Le Battlestar e i viper più moderni vengono letteralmente messi fuori uso e distrutti.Il Galactica è l'unica nave della flotta militare a scampare al massacro e il Comandante Adama il militare con il grado più alto rimasto in vita, così come Laura Roslin, si ritrova improvvisamente ad essere nominata Presidente delle 12 colonie di Kobol dopo la scomparsa della maggior parte dei rapprentanti del gioverno.Gaius Baltar, involontario collaboratore dei cylon (ha dato accesso al mainframe della difesa alla sua bionda amante, rivelatasi poi essere il modello numero sei dei cylon in pelle) riesce a lasciare Caprica salendo sul Raptor di Boomer, grazie alla generosità di Helo che gli cede il posto, dopo averne riconosciuta l'importanza in quanto grande scienziat