La sesta stagione riprende dal momento in cui l'equipaggio, alla fine del film Nell'immenso verde profondo, entrò in un wormhole. La Planet Express uscì dal buco nero e fortunatamente sbucarono vicino alla Terra, ma dopo la fuga da Zapp Brannigan furono colpiti da questi e la navicella si schiantò sul pianeta; morirono tutti eccetto il professor Farnsworth. Quest'ultimo riesce, grazie alle cosiddette cellule stanimali, a riportare in vita tutti tranne Leela, che si trova in coma irreversibile. Distrutto per la perdita, Fry crea un robot con le stesse sembianze della ragazza.