Ancora una volta la CIA spedisce Harm in missione oltreoceano, mandandolo in Libia insieme a Beth O'Neill per 'estrarre' un'agente dal paese. Ma l'uomo intende portare con se tutta la famiglia, costringendo Harm a modificare i loro piani di fuga. Alla base del JAG nel frattempo, un Marine è accusato di essere in collusione con Al Qaeda e Mac è assegnata alla sua difesa.