John sperimenta alcune bizzarre visioni che lo conducono alla vittima senza volto di un omicidio e ad uno stabilimento dove si trovavano gli uomini dell'organizzazione Fenice. La vittima era un agente della NSA sotto copertura; per questo motivo John incontra Sam Clarkson e i due collaborano per incastrare l'uomo con il soprabito. Scoprono che questi non è sordo e parla fluentemente il latino ed il sanscrito. L'uomo rivela a John che Michael è ancora vivo e potrebbe essere la chiave del mistero. Poi usa alcune abilità mentali per fuggire. Sam conduce John da Doya, il quale sottopone l'uomo a dei test che rivelano dove si trovano Theresa e Michael. Questi ultimi, intanto, scoprono l'ubicazione del bastone pastorale: il Vaticano. L'uomo con l'impermeabile uccide Michael e, insieme all'uomo col berretto di lana, fugge portandosi dietro Theresa. John cerca di liberare la donna quando un fascio di luce illumina il volto dell'uomo col berretto di lana: si tratta di Digger.