Con l'aiuto di Adrian, Nikita riesce a raggiungere aree riservate della Sezione per trovare un file, chiamato Gemstone, che contiene le prove per destituire Operations e distruggere la Sezione. Durante un'indagine interna, Michael identifica in Nikita l'operativo che sta collaborando con Adrian contro la Sezione. Michael cerca di convincere Nikita a farsi aiutare da lui per poterla proteggere, ma lei nega ogni evidenza. Michael è quindi obbligato a fare rapporto pur sapendo che Nikita e Adrian verranno cancellate.