Michael e Nikita si spostano continuamente per non essere trovati. Ma la Sezione Uno non demorde e concentra tutte le risorse per recuperare i due operativi. Operations e Madeleine riescono nell'intento di catturarli e riportarli dentro, ma hanno deciso che trattandosi di operativi di un certo valore, soltanto uno dei due morirà. Mr Jones, intanto, il misterioso capo del Centro decide di fare visita alla Sezione destando non poca preoccupazione … infatti egli rivela che Nikita lavora sotto copertura da 3 anni per lui al Centro. In seguito ai numerosi fallimenti della Sezione viene autorizzata una valutazione completa del personale curata proprio da Nikita...