Mentre si festeggia la vittoria, Cesare scopre per puro caso che le suore del convento di Santa Cecilia, tra le quali Ursula Bonadeo, sono state tutte stuprate e uccise. Incarica quindi Michelotto di radunare un gruppo di mercenari, scoprendo nel frattempo che l'atto è stato compiuto dai Francesi con la complicità di Giovanni Sforza. Ludovico Sforza propone al Papa un'alleanza comune per difendersi dai Francesi. Egli accetta, e perciò Rodrigo e Cesare lasciano Roma delegando a Lucrezia la responsabilità di occupare il Trono di San Pietro. Lucrezia prende sul serio il suo ruolo, aiutando i poveri, gli orfani e i bisognosi, mentre Cesare e il gruppo dei mercenari raggiungono l'accampamento francese e lo radono al suolo.