Quando un uomo viene trovato in un fast food con il cranio imploso e deformato, Molly e la sua squadra indagano e scoprono che un aereo ha sorvolato il tratto di mare nel quale si trovava la Big Horn nel medesimo istante in cui è comparso l'oggetto alieno. Le indagini sulla vittima della tavola calda conducono la squadra in un'accademia militare frequentata da giovani ragazzi dove uno dei cadetti potrebbe essere stato "cambiato" ed aver commesso un omicidio.