Quando um coronel da Marinha morre em uma explosão em um campo de golfe, a equipe do NCIS deve investigar um suposto ataque terrorista com a ajuda da Divisão de Investigação Criminal do Exército (CID). A CIA lhes dá uma pista para um armazém abandonado, mas acaba sendo uma armadilha. McGee usa seus conhecimentos para invadir os arquivos secretos do governo para identificar os membros da célula terrorista.