A Agente Especial Danna Scully é designada a trabalhar com o Agente Especial Fox Mulder para validar seu trabalho em um projeto chamado Arquivo-X. Enquanto ele acredita em paranormalidade devido a memória da abdução de sua irmã, ela é uma cientista e prefere procurar por explicações lógicas e racionais. Seu primeiro caso juntos os levam ao Oregon para investigar o assassinato de diversos colegas de uma escola, onde o "Estranho" Mulder acredita fazerem parte de um experimente dirigido por alienígenas.