Прошло 1000 лет с тех пор, как Земля погибла и возродилась как Часовая Планета. Однажды в Киото черный ящик чуть не раздавил Наото Миуру, заядлого любителя часов и механизмов. Внутри этого ящика находится прекрасный автоматон по имени РюЗУ. Поскольку она не движется, Наото решает починить её, полагаясь только на "звук".