Жо и Джин, используя подавляющую боевую мощь своих Гладиаторов, смогли ускользнуть от настойчивых преследований Национальной армии. Однако они были вынуждены вести жизнь в бегах, не зная, когда это закончится. В это время специальное подразделение «Фантом», созданное для подавления «Сопротивления», которое укрылось на атомной электростанции, занимающейся подачей электроэнергии в «Логос», под командованием заместителя командира Рени отправляется на операцию по подавлению мятежников внутри «Логос» и наблюдению за «Левинасом».