В XIX-ом веке двое молодых ученых — доктор Ксавье и Натаниэль Эссекс — спорят о теории Дарвине. Эссекс считает, что мутанты являются следующей ступенью в эволюции и начинает ряд таинственных экспериментов над людьми. Ксавье пытается остановить Натаниэля, но он заходит слишком далеко.