Berättelsen följer Subaru Natsukis dagliga liv, en modern gymnasieelev som förflyttas till en fantasivärld. Han arbetar med Emilia, en ung kvinna med magiska förmågor, och blir vän med andra kamrater. Men de blir snart dödade av en mystisk lönnmördare...
Subaru upptäcker att när han dör vaknar han upp på samma plats där han teleporterades för att återuppleva sin dag. Men kommer hans förmåga att gå tillbaka i tiden att räcka för att undvika alla de tragiska händelser som kommer att drabba honom?