UC 0123. Trente ans se sont écoulés depuis l'ultime révolte de Char Aznable et la Terre connait une période de paix et de prospérité sans précédent. La guerre parait déjà lointaine et Néo-Zéon n'est plus qu'un souvenir. Pourtant, cette quiétude ne durera pas longtemps... La puissante famille Rona, à la tête de l'organisation militaire Crossbone Vanguard, s'empare des colonies spatiales Frontier Side et proclame son indépendance et la création d'une utopie politique: Cosmo Babylone. Pour Seabook Arno et ses amis, c'est le début de l'horreur le jour où Crossbone Vanguard attaque leur colonie. Tandis que Seabook prend les commandes du prototype Gundam F91 pour protéger sa vie, sa petite amie Cecily Fairchild est kidnappée par Crossbone Vanguard...