Katsumi et Isami découvrent dans le journal intime de leurs parents deux illustrations d’Ultraman dessinées par leur mère. Ils apprennent aussi par leur père qu’elle participait à des recherches chez Aizen Tech lorsqu’elle a disparu quinze ans auparavant. Les deux frères décident alors de s’y rendre pour éclaircir cette histoire. Ils y rencontrent alors l’énigmatique évangéliste de l’amour, M. Aizen.