Una de las antiguas némesis de John, el terrorista Malik Ahmad, roba un arsenal de cabezas nucleares y secuestra a un científico para activarlas. John es obligado a trabajar con su enemiga Olga Petrovka para poder destruirlas y rescatar al científico. Mientras tanto, Natalie y Malcom se esfuerzan por proteger la identidad de John frente una investigación del FBI.