Después de Celebrar el Año Nuevo, vuelve a la playa. Quon se aleja y Ayato la sigue. Llegan a unas ruinas ubicadas en el bosque. Al parecer, Quon y Ayato desaparecen y Haruka comienza una búsqueda para encontrarlos. Quon y Ayato están en alguna parte, y la búsqueda de Haruka se detuvo debido al hecho de que no estaban por ningún lado. Haruka termina de regreso en las ruinas, donde Quon y Ayato reaparecen frente a ella nuevamente. Línea de la historia B: Mientras Ayato y Quon están desaparecidos, Itsuki intenta pilotar el RahXephon, pero no lo hace.